Κατά την τοποθέτησή του στην Επιτροπή της Βουλής, ο αναπληρωτής υπουργός Εξωτερικών Γιώργος Κατρούγκαλος ανέφερε πως «προχωράμε σε μία κατεύθυνση για να εξασφαλίσουμε στη γειτονιά μας συνθήκες συνεργασίας και όχι αντιπαράθεσης». Σχετικά με τη γείτονα χώρα σημείωσε πως «έχουν συστήσει διυπουργική για να αλλάξουν στο κράτος τους δρόμους, δημόσιους οργανισμούς κ.α.» και προσέθεσε «αυτοί έχουν αναλάβει πολύ βαρύτερες σε ψυχολογικό και θεσμικό επίπεδο υποχρεώσεις».
«Καλώ, εκτός και ανεξάρτητα κομματικής γραμμής και πειθαρχίας, να αποδεχθούν το Πρωτόκολλο που αποτελεί δεσμευτική συνέπεια και προϋπόθεση της Συμφωνίας των Πρεσπών, που υλοποιεί τα εθνικά μας συμφέροντα, σταθεροποιεί και αναβαθμίζει τον ρόλο της χώρας μας στην ευρύτερη περιοχή», σημείωσε από τον ΣΥΡΙΖΑ ο Νίκος Τόσκας.
Κατά την τοποθέτησή του ο αντιπρόεδρος της Νέας Δημοκρατίας Άδωνις Γεωργιάδης επεσήμανε πως «τον Ιούλιο του 2018, αν ο Καμμένος υποστήριζε την πρόταση δυσπιστίας του κυρίου Μητσοτάκη, θα είχε πέσει η κυβέρνηση και δεν θα περνούσε η συμφωνία. Όλα τα υπόλοιπα είναι για εσωτερική κατανάλωση». Συνέχισε επισημαίνοντας, «ο κύριος Καμμένος μίλησε για μια προδοτική συμφωνία και άρα σας αποκαλεί προδότες. Φάτε λοιπόν το προδότες από τον Καμμένο για να μάθετε με ποιον συνεργάζεστε». Και κλείνοντας επεσήμανε, «προδοσία δεν κάνατε, προδότες δεν είστε, αλλά μεγάλη ζημιά κάνατε στην Ελλάδα».
Παίρνοντας τον λόγο ο Γιώργος Κουμουτσάκος εξαπέλυσε «βέλη» στον πρόεδρο των Ανεξάρτητων Ελλήνων, λέγοντας πως «είμαστε εδώ δεσμευμένοι από τη Συμφωνία των Πρεσπών για να προχωρήσει η ένταξη αυτής της χώρας στο ΝΑΤΟ γιατί τη συνυπέγραφε ο κύριος Καμμένος». Συνέχισε λέγοντας πως «τη συμφωνία των Πρεσπών δεν θα την αγαπήσει ποτέ ο ελληνικός λαός», ενώ έκανε λόγο για «πρότυπο ετεροβαρούς συμφωνίας εις βάρος των συμφερόντων της χώρας».