Τουλάχιστον το 60% από τα έσοδα της πώλησης των δικαιωμάτων ρύπων θα περιέρχονται στον Λειτουργό της Αγοράς (ΛΑΓΗΕ) για τα επόμενα τέσσερα χρόνια, 2016-2020, σύμφωνα με νομοθετική ρύθμιση του υπουργείου Περιβάλλοντος – Ενέργειας, που περιελήφθη στο νομοσχέδιο για το παράλληλο πρόγραμμα, το οποίο κατατέθηκε στη Βουλή.
Ποσοστό 10% από το ποσό αυτό θα καλύπτει τις ανάγκες των μεγάλων ενεργοβόρων βιομηχανιών, καθώς ανήκουν στην κατηγορία των δραστηριοτήτων που εκτίθενται στον κίνδυνο διαρροής άνθρακα (carbon leakage), δηλαδή στον ανταγωνισμό από ανάλογες επιχειρήσεις εγκατεστημένες σε χώρες που δεν εφαρμόζουν τόσο αυστηρά και ακριβά περιβαλλοντικά μέτρα. Το υπόλοιπο ποσό θα διατίθεται σε φορέα εποπτευόμενο από το υπουργείο Περιβάλλοντος και Ενέργειας για την υλοποίηση έργων, όπως η εξοικονόμηση ενέργειας, τα αντιπυρικά, η μείωση εκπομπών αερίων του θερμοκηπίου κλπ.
Οι πόροι που περνούν στον ΛΑΓΗΕ θα χρησιμοποιηθούν για την πληρωμή των παραγωγών ενέργειας από ΑΠΕ.